遵照共和国革命军事委员会1922年5月6日命令，共和国武装力量西伯利亚副总司令司令部改编为西伯利亚驻军司令部，驻新尼古拉耶夫斯克（新西伯利亚），并恢复西西伯利亚军区。

军区辖彼尔姆、叶卡捷琳堡、车里雅宾斯克、托博尔斯克、鄂木斯克、阿尔泰、新尼古拉耶夫斯克和托木斯克培省。

1923年1月，东西伯利亚军区撤销，共辖区划归西西伯利亚军区，同年5月，西西伯利亚军区辖区彼尔姆、叶卡捷琳堡、车里雅宾斯克和托博尔斯克四省划归伏尔加河沿岸军区。

国内战争年代，西伯利亚官兵和游击队并肩战斗，并粉碎高尔察克白卫军、谢苗诺夫匪帮、温甘伦男爵匪帮及从西伯利亚、远东驱逐外国武装干涉军的功业中做出了应有的贡献。

西伯利亚许多团和师在国内战争其他战线也无比英勇奋战。

遵照共和国革命军夺委员会1924年6月12日命令，西西伯利亚军区改称西伯利亚军区，西伯利亚和远东的所有驻军及各级军事机关均属其建制。

尔后几年，军区积极参加清剿富农匪帮，并支援西伯利亚和远东劳动人民恢复国民经济。

1924-1925年军事改革时期，军区组建了许多地方兵团和部队（其中包括布里亚特蒙古和雅库特各民族部队），开办了20余所培训红军指挥员的训练班，截至1928年，这些训练班编为2个步兵学校和1个炮兵学校。

1920年远东特别集团军组建，军区许多兵团和部队编入该集团军，其辖区亦有所扩大，原西西伯利亚边疆区、奥伊罗特和哈卡斯两自治州，以及克拉斯诺亚尔斯克边疆区（1935年5月起）先后划归该军区。

历任司令：1919年12月-1920年M.希波夫、1920年И.Л.科甘、1920-1921年B.И.绍林、1922-1923年C.B.姆拉奇科夫斯基、1923年和1925-1928年П.H.佩京、1923-1924年和1933-1937年Я.П.盖利特、1924-1925年P.П.埃德曼、1925年M.M.拉舍维奇、1928-1930年H.B.古比雪夫

远东军区组建之前，曾经历过组织军事领率机构、组建远东第一批红军正规部队及其在国内战争年代英勇作战的一段较长的历史。

远东地区第一个苏维埃军事行政机构是东西伯利亚军区（领率机关设在哈巴岁夫斯克（伯力））。

军区是奉人民委员会1918年5月4日第401号命令组建而成的。

1918年9月，由该军区所属部队组建了格罗杰科沃方面军，同年7月该方面军改编为乌苏里斯克方面军。

1918年7月31日，该方面军在考利斯克高地、什马科夫卡和斯帕斯克地域粉碎了白卫军和捷克叛军。

1920-1922年，远东苏军的作战指挥和领率机关的职权由远东共和国人民革命军执行。

1922年2月，远东共和国部队在沃洛价耶夫卡、斯帕斯克城下歼灭白卫军和日本占领军主力，并于10月末进入符拉迪沃斯托克（海参葳），从而收复了整个远东。

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