隨著碇源堂身死人不見NERV也徹底易主，如今在NERV總部的島國防衛軍人員比起NERV的人多出了幾倍。
整個NERV的人也全都被監管起來各個重要的部門不是被蕭雲的人守著就是被島國防衛軍的人給封鎖。
不過隨著赤木律子，加持良治以及葛城美里的介入情況也逐漸開始有所變化，一個個稽核完成的原NERV成員回到了自己的工作崗位。
現在的情況是蕭雲雖然擁有了NERV總基地的所有權但兵不知將，將不知兵，直接指揮肯定是不可能的。
蕭雲對NERV也缺乏瞭解所以最好的方法還是讓赤木律子，加持良治和葛城美里三人來幫他先穩住現在的局面。
包括對人員的稽核，物資裝置等等各方面都需要熟悉情況的人來處理，可這稽核還沒進行一半NERV的警報就響了起來，一下就讓NERV直接進入了戰鬥狀態。
“警報藍色，使徒來襲，各成員進入崗位。”
蕭雲在警報響起的時候就有注意到，第一時間也趕來了作戰指揮部。
“什麼情況，不用做出擊準備？”
已經換了一身制服的葛城美里表情沉重的轉頭看向蕭雲：“這次的使徒是無法用EVA能夠對付的敵人。”
蕭雲挑挑眉毛看向螢幕：“哇哦，病毒型使徒。”
“現在很麻煩，我們只能延緩這些病毒的入侵，照這樣的速度下去遲早會被侵入中央教條。”
“別怕。”蕭雲大氣的揮了揮手。
“你有辦法解決？”
“雖然覺得有點可惜。”蕭雲輕輕嘆了口氣，道：“我已經讓人在基地下方佈置了空間武器維度吞噬者，隨時能夠把莉莉絲給徹底毀滅掉，我惟一不太清楚的一點是莉莉絲和人類之間的聯絡到底有多緊密。”
加持良治道：“沒有關係，只要沒有開始契約莉莉絲就不可能對人類造成任何影響。”
“那就沒事了。”蕭雲點頭道：“我隨時可以啟動空間武器，沒有後顧之憂你們也可以想想可以用什麼樣的辦法來對付這種敵人。”
蕭雲是真的不慌，他記憶裡有關於這個使徒的劇情，知道最後是有驚無險的解決掉了，而且可以說是最容易解決的一個。
不用EVA不用AT力場唯一一個用人類的智慧就能解決的敵人。
當然最關鍵的是那顆足以讓莉莉絲徹底消失的維度吞噬者。
蕭雲很輕鬆的坐在了原本應該屬於碇源堂的位置上，就這麼輕鬆的看著葛城美里等人的表演。
有了蕭雲的話作戰指揮部的氣氛也顯得鬆弛了很多，但是遇見這種情況葛城美里他們還是難以找出合適的方法。
“使徒又經侵入MAGI！它好像在進化！”
忽然間有人著急的喊了出來：“自爆程式自主啟動，我們還有十分鐘時間！”
蕭雲的表情頓時變得古怪起來，赤木律子額頭上冒出來了些汗水，一直注意著使徒的情況：“它在進化，等等……這是……它的行為邏輯正在改變！我想到辦法了！”
“等等。”蕭雲的表情忽然變得古怪起來，看向身邊的御劍冥夜：“關閉自爆程式。”
御劍冥夜點點頭使得整個作戰指揮部那尖銳的警報聲忽然安靜了下來。
作戰指揮部內，嘈雜的聲音忽然也全部消失，所有人都愕然的看向了蕭雲的方向。
“情況怎麼樣。”
赤木律子滿臉愕然：“侵襲還在繼續，但是為什麼？”
蕭雲道：“你剛才說它的邏輯在發生變化，生命形式呢？”
赤木律子連忙道：“它已經具備了電子病毒的特徵。”
蕭雲眉頭微皺，他在考慮一個很有意思的事情。
那就是把這個使徒納為己用。
使徒侵入了NERV的主電腦MAGI，但現在的問題是這臺電腦正處於蕭雲的控制，而且是一種這個世界根本不存在的量子病毒。
使徒侵襲MAGI轉變成了一種病毒，但也是基於MAGI這個電腦進化而成的病毒，量子病毒是否能和使徒對抗，使徒又是否能夠因為接觸量子病毒而獲得量子病毒的特性。
不過唯一可以確定的是量子病毒不會成為任何東西的載體，而量子病毒依然能夠控制已經被使徒侵襲的MAGI。
使徒病毒對上量子病毒……
“能把使徒徹底限制在MAGI中嗎？”
蕭雲看向赤木律子，後者思索著點頭道：“我可以試試。”
赤木律子很快開始給使徒設下陷阱將其困在了MAGI中，在敲下陷阱牢籠關閉的一剎那便立刻轉頭看向了蕭雲。
“三十秒，最多隻有三十秒的時間！”
蕭雲也不耽誤直接把頭盔蓋在了頭上。
“VT！”
“正在嘗試封鎖……封鎖已完成，封鎖時間延長到三分鐘，開啟第二規程，加速使徒進化，預計時間十秒……蕭雲，設想出錯……”
“為什麼？”
VT：“使徒具備生命特質已經現實病毒軀體並在快速進化，無法做到完全資料化，持續加速進化最終只有一個結果，崩潰。”
蕭雲有些可惜的嘆了口氣：“解決它，可惜了真正的資料生命就在我眼前被錯過了。”
“蕭雲，我們可以將資訊以量子態方式輸入使徒病毒的資料之中，病毒無法接受GEASS但是使徒可以。”
蕭雲忽然就明白了VT的意思，頓時開啟了GE ASS：“沉默！”
忽然間正在突破的使徒猛的沉靜下來，一層層作為封閉的防火牆也穩定下來。
蕭雲眼睛頓時亮了起來，GEASS真的有用！
不過這種情況也是因為這次入侵使徒的特殊性導致的，同時處於電子病毒和生物病毒的雙形態下讓VT找到了關鍵的弱點。
原劇情中NERV就是因為使徒的這個特性加速它的進化而被毀滅。
現在的情況也是因為如此，蕭雲和VT連結同頻，作為人工智慧VT不會受到蕭雲的影響，蕭雲也無法透過拉進來第二個人類和VT同頻影響到對方，因為資訊的傳遞過程中經過了兩次轉換，單一的影響已經被VT完全過濾。
可是對於現在的這個使徒VT根本不需要對資訊進行任何調整甚至都不需要自己作為中介，直接把蕭雲的精神訊號傳遞給使徒，若是使徒作為完全的電子病毒自然不會受到影響，但使徒並不是這種情況，它還具備生命的特點。
“漂亮！”
蕭雲哈哈一笑從椅子上站了起來，再次利用GEASS影響使徒將其塞進了一個硬碟之中並給出了沉睡的引導。
蕭雲拿著硬碟簡直是如獲至寶，這麼久了現在終於有了第一個被自己抓住的使徒，這成就感滿滿的，關鍵是這個使徒是真的特殊啊，真正意義上的電子生命啊。
正當蕭雲想著到時候交給誰來研究時，赤木律子卻是想要將蕭雲手中的磁碟給帶走。
“這東西太危險了，我們必須要立刻銷燬。”
“不行不行。”蕭雲把硬碟捏在手裡不停搖頭：“這東西對我有大用處。”
赤木律子微微皺眉：“你難道還想要研究這個嗎。”
蕭雲哈哈笑道：“資料生命和生物生命的共同體，這研究價值不大？”
赤木律子看了看蕭雲手中的硬碟，忽然覺得好像還真有很大的研究價值，不是以使徒的方式研究，而是從生命形態的方式。
“不管如何現在也都需要確保這東西處於最安全的情況。”
葛城美里走過來將手搭在了赤木律子的肩膀上，對這蕭雲道：“最好用封印柱先進行封印。”
“封印柱？”
這是一個蕭雲沒有接觸過的新名詞。
葛城美里道：“一種可以封印限制使徒的東西，能夠限制使徒的力量。”
蕭雲看了看手中的硬碟，點頭：“行，先封印著。”
現在這玩意拿在手上也沒什麼用，在這個世界研究這種東西確實不安全，雖然蕭雲覺得就這麼拿在手上應該也沒多大問題，哪怕是這個使徒侵蝕自己問題應該也不大。
可好好的誰喜歡被這種奇奇怪怪的東西侵入自己的身體，用那什麼封印柱也就是多加一層保險，安全性更高也能讓人放心一些。
不過這玩意在蕭雲心目中的價值確實很高，EVA這種東西是好用也能成為一種新型量產兵器，但EVA除了成為兵器還能有什麼用呢，這個使徒就不一樣了甚至可以用到各方各面。
真正的自律型戰鬥兵器，次世代的超級智慧電腦，說不定還能製造出威震天和擎天柱。
這一比起來EVA簡直就是渣渣。
危機解除，後續對NERV成員的稽核也持續性的進行著。
自己服毒然後又被蕭雲一句話激起了求生欲，莫名其妙在陰陽兩界轉了一圈的冬月也終於被帶到了蕭雲面前。
坐在原本屬於碇源堂但標誌已經完全更改為曙光標誌的辦公室裡，蕭雲穿著黑色的外套手上戴著手套，臉上戴著一副特殊眼鏡，雙手交叉搭載一副碇源堂的樣子。
被加持良治帶進來的冬月見到這樣的蕭雲這個樣子也是眼角抽搐。
“蕭雲先生。”
“嗯。”蕭雲深沉的應了一聲，淡淡道：“既然沒事就重新回到工作崗位。”
加持良治站在一邊輕輕的嘆了口氣：“蕭先生，你這樣覺得很有趣嗎？”
蕭雲平靜道：“不，一切都是嚴肅的，所有的一切都在計劃之中，接下來我們必須要完成後續的計劃，SEELE必須要毀滅，屬於他們的最後基地月球也必須落入我們手中。”
“今天把你們叫來的目的你們已經清楚了，我必須要開啟通往回歸的大門，但是要做到這點就必須徹底毀滅SEELE。”
冬月瞳孔收縮：“你真的是神！？”
“別好了好嗎蕭先生。”加持良治一臉無奈，捂臉道：“能不能好好說話。”
蕭雲咧嘴一笑，剛才的深沉一下消失得無影無蹤：“說真的現在有沒有辦法前往宇宙。”
冬月愣了愣，點頭道：“有，隨時都可以，SEELE在宇宙的基地基本沒有防禦措施，但最大的問題是那裡有在建的六號機，我們卻無法把EVA送上宇宙。”
“那這麼說我們就只能被動的等著他們下來？”蕭雲搖搖頭，看向加持良治。
加持良治道：“我已經找到了SEELE的維生元件，也已經關閉了所有能源但不能確定這樣是否能殺死SEELE。”
兩人的目光又放在了冬月身上，冬月搖頭：“我不知道，但是他
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